Los socios estratégicos para el CEPCU son las comunidades y organizaciones comunales de segundo grado, así como también las organizaciones internacionales y nacionales entre las cuales podemos mencionar:

• Fundación Broederlijk Delen.
• Fundación InterAmericana IAF.
• Voluntario de Naciones Unidas VNU.
• Heifer Project International HPI.
• Oxfam América.
• International Weiterbildung und Entwicklung gGmbH -InWEnt.
• Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo PNUD.
• Fundación Hanns Seidel.
• Cooperación Internacional para el Desarrollo CID.
• Community Fund National Lottery - PROGRESSIO.
• Fondo Ecuatoriano de Contravalor Suizo FOES.
• Agencia Canadiense para el Desarrollo Internacional ACDI.
• Fondo para el Desarrollo de los Pueblos Indígenas de América Latina y el Caribe.
• InterAmerican Networking for Studies and training in Natural Resourses in Community Transformation INSTRUCT.
• Ministerio de Agricultura, Ganadería, Acuacutura y Pesca MAG.
• Consejo de Desarrollo de las Nacionalidades y Pueblos del Ecuador CODENPE.
• Proyecto de Desarrollo de los Pueblos Indígenas y Negros del Ecuador Regional Sierra Norte PRODEPINE.
• Gobierno Municipal de Otavalo GMO.
• Consejo Provincial de Imbabura.
• PROBONA FOSEFOR.
• Coordinadora Ecuatoriana de Agroecología CEA.
• Red para el Manejo Comunitario de los Recursos Naturales MACRENA.
• Desarrollo Forestal Campesino DFC.
• Ministerio de Inclusión Económica y Social MIES.
• Ministerio del Ambiente.